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Codel筛选平台有助于有效发现特定的氨基酸共价抑制剂

研发家 | 2025-05-08
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中国科学院上海药物研究所研究员陆晓杰研究小组、艾菁研究小组与谭敏佳研究小组合作,建立了一个共价DNA编码化合物库,集成了各种不同氨基酸残基靶向弹头(CoDEL)选择平台扩大了共价抑制剂的合理设计范围,为缓解目标突变影响、满足目标特异性要求提供了一种方法,有助于更准确的治疗干预。4月28日,相关研究在《美国化学协会志》上发表。

共价药物可以与目标的特定残留基础形成共价键,从而在癌症的关键点发挥特定作用,实现精确的肿瘤治疗。目前,共价靶向策略已扩展到9种氨基酸残留基础,但如何快速有效地根据不同的氨基酸找到共价抑制剂仍然是共价药物发现的难题。

Codel技术具有快速生成数亿级共价化合物的能力。其化合物库的规模远远大于商业可购买的共价化合物库。它是一个理想的平台,集成亲电弹头,进行特定的残基靶向筛选。

成纤维细胞生长因子受体2(FGFR2)激酶家族蛋白是癌症治疗的关键目标。基于对17种共价弹头和FGFR2中9种氨基酸残留基础的反应性系统评估,研究小组建立了Codels,含有2480万种化合物,并发现了FGFR2共价抑制剂,用于靶向半胱氨酸、赖氨酸、精氨酸或谷氨酸。

具体来说,半胱氨酸靶向共价抑制剂CF3对FGFR2表现出强烈的抑制作用;赖氨酸靶向共价抑制剂KF7揭示了一个以前没有特征的反应点,解决了靶向常规反应点的限制;精氨酸靶向共价抑制剂RF3是一种高选择性FGFR2/3抑制剂,显示了FGFR2 V564F门控突变的显著抑制活性;谷氨酸靶向共价抑制剂AF1确认了残留基础作为共价药物组合点的可行性,为未来开发更高效的共价抑制剂奠定了基础。

研究小组表示,这项工作证明了使用多弹头Codel筛选平台发现不同残基靶向共价抑制剂的可行性。该策略不仅可以扩大共价药物的目标空间,还可以进一步发挥Codel技术在精确治疗中的应用潜力,为难以成为药物靶向的药物开发提供新的思路和重要途径。

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