世界上第一个木薯液相繁殖芯片研发成功

近日，中国热带农业科学院热带生物技术研究所功能基因组和分子育种研究小组开发了木薯35K液相繁殖芯片，对木薯功能基因组研究和基因组选择繁殖具有重要意义，进一步提高了我国木薯繁殖的技术创新能力。园艺研究发表了相关研究成果(Horticulture Research)。

木薯(Manihot esculenta)它是大戟科木薯的一种植物，是世界三大重要土豆作物之一，具有耐旱、耐贫瘠、高产等优良特性。开发一个低成本、高通量、高灵活性、高效率的基因分类平台，对木薯功能基因组的研究和基因组的选择繁殖具有重要意义。

多态性单核苷酸(SNP)芯片作为一种完善的基因分类技术，可以用于高通量检测基因组中的SNP位点。SNP芯片的优点包括高通量、准确性、准确性和相对较低的成本。在农业领域，SNP芯片广泛应用于群体遗传分析、遗传图谱建设、全基因组关联分析和品种权保护。

研究小组选择了35369个高多态性、低缺失率、均匀分布的基因位点，基于377个木薯种质全基因组SNP标记、2980种代谢物QTL和23个田间农艺特性等信息。其中，586个与特性密切相关的SNP作为探针设计的前景点，成功研发出世界上第一个木薯液相繁殖芯片。GenoBaits Cassava35K。

该基因芯片在人群多样性分析、系统发展分析和全基因组关联分析方面取得了良好的效果。该芯片的研发也有助于缩短木薯的繁殖周期，提高繁殖效率，进一步提高中国木薯繁殖的技术创新能力。

该研究得到了海南省重点研发项目、国家自然科学基金、热带作物生物育种国家重点实验室研究的支持。