火龙果滞绿新机制的新研究揭示

近日，华南农业大学园艺学院教授胡桂兵/秦永华团队研究发布了火龙果首个端粒到端粒(T2T)水平基因组和火龙果病毒污染的转录纯化系统揭示了叶绿素降解通道在不同果皮颜色火龙果中控制差异的分子机制。《植物学报》发表了相关结果(Journal of Integrative Plant Biology)。

在国家自然科学基金、广东省自然科学基金等项目的资助下，本研究利用ONTT、PacBio SMRT、Illumina和Hi-C四种测序技术对“双色一号”火龙果进行了全基因组测序和组装，在T2T水平上获得了高完整性、连续性和组装质量的火龙果基因组，同时获得了两个高质量的火龙果基因组，即“红花青龙”(绿皮白肉)和“红皮红肉”(红皮红肉)。

基于参考基因组的对比，研究人员发现Cactuss广泛存在于火龙果转录组中。 virus X、Pitaya virus X、Schlumbergera virus X、Zygocactus virus X和Guangxi 五种病毒，alphaflexivirus。为解决这个问题，他们设计了一个寡核苷酸池，用于特定消化火龙果中的病毒转录，并开发了一个高效、新颖、普遍的火龙果转录纯化系统。

根据火龙果基因组中的结构变异和纯化后的优质转录组数据，确定了HuERF72，HuERF72，HuERF72和HuSGR1启动子之间的相互作用，抑制了HuSGR1的表达，从而阻碍了火龙果皮叶绿素的降解。

对HuERF72-HuSGR1转录调控引起火龙果滞绿的调控网络进行了分析，为火龙果实色彩调控提供了重要参考。